La Junta Directiva de Perú está compuesta por seis miembros, cinco de Perú y uno de los Países Bajos. La mayoría de ellos son responsables de uno o varios proyectos en Perú, además de sus funciones en la Junta. Uno de los miembros de la junta, Aukje van de Kamp, sirve de enlace con la junta de los Países Bajos.